GWAS数据和软件下载

这部分主要是数据获取,以及软件配置方法。

一、配套数据和代码

数据和代码目前在不断的更新,最新的教程可以私信,我通过后手动发送最新版的pdf和数据代码。发送的压缩包,有电子版的pdf和数据下载链接,里面是最新的百度网盘的地址,下载到本地即可。然后根据pdf教程,结合配套的数据和代码,跑通代码,修改代码,理解代码,进而理解流程,掌握流程。

二、安装软件

我们需要三个软件,分别是:

R语言4.3

plink1.9

git软件(windows系统需要,其它系统不需要)

1、R语言

下载地址: https://cran.r-project.org/bin/windows/base/

​2、plink软件

下载地址:plink: https://www.cog-genomics.org/plink/

3、git软件

下载地址: https://git-scm.com/downloads

4、Rstudio

下载链接: https://posit.co/download/rstudio-desktop/

获得配套数据和代码之后,按照以上安装软件。下一期介绍9套GWAS配套数据。

"sgmediation.zip" 是一个包含 UCLA(加利福尼亚大学洛杉矶分校)开发的 sgmediation 插件的压缩包。该插件专为统计分析软件 Stata 设计,用于进行中介效应分析。在社会科学、心理学、市场营销等领域,中介效应分析是一种关键的统计方法,它帮助研究人员探究变量之间的因果关系,尤其是中间变量如何影响因变量与自变量之间的关系。Stata 是一款广泛使用的统计分析软件,具备众多命令用户编写的程序来拓展其功能,sgmediation 插件便是其中之一。它能让用户在 Stata 中轻松开展中介效应分析,无需编写复杂代码。 下载并解压 "sgmediation.zip" 后,需将解压得到的 "sgmediation" 文件移至 Stata 的 ado 目录结构中。ado(ado 目录并非“adolescent data organization”缩写,而是 Stata 的自定义命令存放目录)目录是 Stata 存放自定义命令的地方,应将文件放置于 "ado\base\s" 子目录下。这样,Stata 启动时会自动加载该目录下的所有 ado 文件,使 "sgmediation" 命令在 Stata 命令行中可用。 使用 sgmediation 插件的步骤如下:1. 安装插件:将解压后的 "sgmediation" 文件放入 Stata 的 ado 目录。如果 Stata 安装路径是 C:\Program Files\Stata\ado\base,则需将文件复制到 C:\Program Files\Stata\ado\base\s。2. 启动 Stata:打开 Stata,确保软件已更新至最新版本,以便识别新添加的 ado 文件。3. 加载插件:启动 Stata 后,在命令行输入 ado update sgmediation,以确保插件已加载并更新至最新版本。4
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