R安装Github包出现 Failed to install ‘unknown package‘ from GitHub

最新推荐文章于 2024-12-14 16:02:56 发布

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分类专栏： R Linux 文章标签： github git

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本文介绍了在R中安装GitHub包时遇到的速率限制错误及解决方案。通过生成并配置GitHub API Token，可以成功安装包。首先在GitHub上创建Token，设置有效期为7天，然后使用usethis包的函数编辑R环境变量，添加Token。最后重新运行安装命令即可。如果安装devtools等包失败，检查是否缺少依赖并进行安装。

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R安装Github包出现 Failed to install ‘unknown package’ from GitHub

根据错误提示，我们知道出现这个错误的原因是：Github API速率限制，我估计是 devtools 这个包里做了相关限制，因为直接git clone是没啥问题的。

没关系，根据错误提示，我们添加下自己的：Github API Token即可。

第一步： Github API Token 生成：点击这里登录后，直接新建

这里的Expiration建议选7天，避免泄露造成不必要的麻烦。

其他人可以使用这个token对你的github仓库做任意修改。

第二步： 配置 Github API Token，

To increase your GitHub API rate limit
  - Use `usethis::create_github_token()` to create a Personal Access Token.
  - Use `usethis::edit_r_environ()` and add the token as `GITHUB_PAT`.

比如我们输入usethis::edit_r_environ()，然后在文件中写入：

GITHUB_PAT="你自己的token"

这是以 vim 方式打开的，输入完成后先按 ESC 按钮，然后按shift+:（英文输入法），输：wq，然后按回车即可。

需要先退出，然后在进入R，添加的环境变量才会生效。

第三步： 再次输入指令安装。

devtools::install_github('Rapporter/pander')

额外的，如果你安装devtools出错，仔细看下错误原因即可，一般是缺依赖。

apt update && apt install libicu-dev liblapack-dev libblas-dev libcurl4-openssl-dev libtool pkg-config libssl-dev liblz4-dev libxml2-dev libzstd-dev -y && apt install libharfbuzz-dev libfribidi-dev libfontconfig1-dev libfreetype6-dev libpng-dev libtiff5-dev libjpeg-dev libgmp-dev -y