【深度学习】深入浅出nnUnet的数据处理方法

本文深入解析nnUNet数据处理方法,包括数据预处理的crop、预测结果可视化、三维医学图像的通用预处理流程。预处理涉及数据格式转换、图像裁剪、重采样和标准化。nnUNet的crop方法通过ImageCropper类实现,用于减少计算量。数据转换通常将DICOM、MHD或NIFTY格式转为numpy数组。预处理还包括重采样以保持体素空间一致性,以及标准化以统一灰度值分布。

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【深度学习】深入浅出nnUnet的数据处理方法

文章目录
1 nnUNet数据预处理crop方法
2 预测结果可视化
3 如何针对三维医学图像分割任务进行通用数据预处理:nnUNet中预处理流程总结
	3.1 数据格式转换
	3.2 图像裁剪Crop
	3.3 重采样Resample
	3.4 标准化Normalization
4 后处理

1 nnUNet数据预处理crop方法

plan_and_preprocess
运行分割,首先需要对数据集进行数据预处理,这也是nnUNet的精髓所在。

nnUNet_plan_and_preprocess -
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