科研绘图系列：R语言绘制韦恩图（Venn plot）

韦恩分析（Venn Analysis）常用于可视化不同数据集之间的交集和并集。维恩图（Venn diagram），也叫文氏图、温氏图、韦恩图、范氏图，用于显示元素集合重叠区域的关系型图表，通过图形与图形之间的层叠关系，来反应数据集之间的相交关系。在 R 语言中，进行韦恩分析（Venn图绘制）可以通过多个不同的包来实现，常用的包括 VennDiagram、venn 和 ggVenn 等。本文案使用ggVenn软件包进行分析。

比较经典的韦恩图是使用venndiagram作图，但是缺点是不能使用pdf导出图形，对后期组图带来麻烦。基于ggplot2的ggVennDiagram这个package就能方便导出pdf，以利于后期组图，绘制符合杂志社要求的图片。

今天带领大家绘制的是韦恩图（Venn diagram），韦恩图属于关系型图表，通过圆圈与圆圈之间的重叠关系，来表示集合与集合之间的相交关系。一般来说韦恩图只适用于小于等于5个集合的场景，如果集合过多，一方面是不美观，另一方面是常用的R包也不支持。这种情况可以考虑花瓣图或者Upset图等，后续我们都会更新。

通常，大家对维恩图的了解较多，因为它在所发表的文章中比较常见。然而，当集合的数量种类较多（超过5个时），其可视化显得杂乱无章。事实上，这两类图所展示的内容的本质是一样的，可以根据自身的实际情况，选择合适自己文章的图形。时，相比于维恩图，集合图展示的结果（不同组的特有或共有信息）依然清晰（当然集合图也是可以改颜色的，这个大家不用担心并不是如此黑）。因此，我们要做的就是根据自己数据的情况，选择合适的集合图形。在进行数据的集合可视化时，即突出不同处理、各组样本之间独有或共有的特征或元素，可以利用。

ggsave("韦恩图.png", plot = p1, width = 10, height = 8, dpi = 150)+ text = element_text(size = 16) # 设置字体大小为 16。分辨率高了很多，这只是最基本的用法，想要画一个好图，得需要多次修改。> data <- read.xlsx("韦恩图种2.xlsx")

韦恩图（Venn diagram）是一种常用的图形工具，用于展示集合之间的关系。通过交叉区域和独立区域的组合，韦恩图可以直观地展示不同集合之间的重叠和独特元素。在R语言中，我们可以使用一些包和函数来创建韦恩图，其中最常用的包括。图中的交叉区域表示不同集合之间的重叠部分，而独立区域则表示每个集合的独特元素。包，我们可以轻松地创建具有不同样式和自定义选项的韦恩图，以展示集合之间的关系。该包提供了更多的自定义选项，可以绘制更复杂的韦恩图。函数，可以根据输入的集合信息生成韦恩图的数据。参数指定了每个集合的名称，

【科研绘图系列】R语言绘制小提琴图、散点图和韦恩图（violin & scatter plot & Venn）

matplotlib_venn【2~3组数据，可以更个性化设置】； pyvenn【2~6组数据】

其中，category.names参数用于设置每个集合的名称，fill参数设置每个圆形的填充颜色，alpha参数设置圆形的透明度，label.col参数设置标签的颜色，cex参数设置标签的大小，margin参数设置图形的边距。通过观察韦恩图，人们可以更清晰地了解集合之间的关系，进而做出更准确的决策。韦恩图利用圆形的重叠区域来表示集合之间的交集，而圆形的非重叠区域则表示各个集合的独立部分。每个集合在图中用一个圆形表示，而每个圆形之间的重叠区域表示相应集合之间的交集。

需要安装和导入的包 install.packages("VennDiagram") library(grid) library(futile.logger) library(VennDiagram)已知各个数据集的个数，并且交叉个数来制作韦恩图两个数据集：# A simple two-set diagram （根据数据量多少而确定圆的大小）venn.plot &lt;- draw.pairwise...

维恩图（Venn diagram），也叫文氏图、温氏图、韦恩图、范氏图，用于显示元素集合重叠区域的关系型图表，通过图形与图形之间的层叠关系，来反应数据集之间的相交关系。当前R语言中的VennDiagram包可用于2元到5元的图维恩绘制，而大于5元的情况这需要借助R语言的另一个R包——关注公众号，发送“Venn”获得完整代码以及演示数据包。UpsetR包（下期将做展示）。好了本次分享就到这里。

详解R语言画韦恩图 原创飘羽 发布于2018-07-09 17:15:19 阅读数 8472 收藏 展开 需要安装和导入的包 install.packages(“VennDiagram”) library(grid) library(futile.logger) library(VennDiagram) 已知各个数据集的个数，并且交叉个数来制作韦恩图 两个数据集： A simple two-se...

Venn图，又称文氏图，标题中其他名字也是它的别称，由封闭圆形组成，代表不同集合。圆形重叠部分表示集合交集，非重叠处为独有元素。在生物学、统计学等领域广泛应用，可展示不同数据集相似性与差异，辅助逻辑分析。以直观方式呈现复杂集合关系，是有力的可视化工具。

R语言实现高级的韦恩图可视化（UpSetR）

笔者主要如何用R语言绘制韦恩图，并使用多种调色板