GWAS数据介绍之data1

GWAS-data1

这个数据,来源于github的数据,修改了里面一些bug,重新整理了一下。

原来的数据地址: https://github.com/MareesAT/GWA_tutorial/

1_QC_GWAS
文件夹
主要是根据一些常用的基因型数据质控,包括maf、缺失、杂合度、哈温平衡等。

其中1_Main_script_QC_GWAS.txt里面包括所有运行的代码,基因型文件是plink格式的二进制文件, .R 是几个用于检测结果以及可视化的R脚本,我们后面会依次讲解这些代码。

2_Population_stratification
这部分,主要是群体结构分析,包括MDS分析。

3_Association_GWAS
里面主要包括常用GWAS分析方法。

整套GWAS配套数据想要领取可私信。

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值