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RSS订阅原创 FASTQ质控软件FASTP下载和运行
使用批量质控的方法：vim .sh创建文件夹 ，i-编辑；将质控命令复制进去，修改所在文件夹，我数据在不同文件夹需要自己修改。esc，shift+：，wq保存退出，sh fastp .sh即可。使用fastp 软件进行质控，chmod a+x fastp使其可运用./fastp；可使用系统默认质控参数。2,使用wget进行安装：wget http://opengene.org/fastp/fastp。1. 使用conda进行安装：conda install fastp。质控完成后显示数据。
2023-04-20 22:07:07
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原创 生信小白 下载SRA转录组数据转换成fastq格式
r, -R：–recursive 递归删除，将指定目录下的所有文件与子目录一并删除。删除文件 rm file.txt 强制删除文件 rm -f file.txt。删除文件夹 rm -r -f, 一步到位。我在下载过程中网络中断，删除了未下载完的文件夹，使用删除命令remove-rm。-f：–force 不提示，强制删除文件或目录，但是会忽略不存在的文件。-i：–interactive 进行交互式删除，删除前逐一询问确认。-v： --verbose 详细显示进行的步骤。
2023-04-13 19:37:49
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空空如也
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