- 博客(26)
- 收藏
- 关注
RSS订阅原创 利用二级结构和contact引导的差分进化来进行蛋白质结构的预测
文章题目：Secondary Structure and Contact Guided Differential Evolution for Protein Structure Prediction最近看了师兄的论文，打算写个博客记录一下，免得几个月后又忘记了。好记性不如烂笔头，这个懒不能偷，血的教训，去年把杨建益老师的trRosetta理解了一遍，放了4个月的寒假，再拿起来看，脑子里全是问号，好生气！目前，主要有两个问题严重地限制了蛋白质结构预测的准确性。1.在巨大的构想空间中寻找接近天然态的
2020-05-21 21:15:12
1342
原创 将npz文件转化为txt文件中出现错误（ValueError: Expected 1D or 2D array, got 3D array instead）的解决办法
seq.npz直接使用Notepad++打开发生错误，试着使用python去读这个文件包。import numpy as np# %%seq_data = np.load('seq.npz')print(seq_data.files)# %%dist = seq_data['dist']omega = seq_data['omega']theta = seq_data['theta']phi = seq_data['phi']np.savetxt('seq_data.txt',dis
2020-05-21 20:08:04
10571
2
原创 为什么协方差矩阵求逆可以消除间接耦合
之前看论文的时候，发现协方差矩阵求逆就是精确矩阵，一直非常难以理解，为什么协方差矩阵求逆可以消除间接耦合。一般情况下，如果想知道两个随机变量之间的关系，可以利用协方差矩阵，计算相关矩阵系数来得出它们之间的关系，若相关矩阵系数为0，则它们之间的关系是独立的，若相关矩阵系数>0，则它们呈正相关的关系，若相关矩阵系数<0，则它们呈负相关系数。但是通过与正确结果相比，这个矩阵显示出的信息是粗糙的。比如一条序列有n个残基，两两残基之间的关系，真实的情况中有5%的残基对之间是独立的，但是利用协方差矩阵计算出
2020-05-18 22:19:37
2906
1
原创 贝叶斯算法的理解（结合拼写纠正实例和垃圾邮件实例）
1.贝叶斯要解决的问题：(1)正向概率：假设袋子里面有N个白球，M个黑球，你伸手进去摸一把，摸出黑球的概率有多大。(2)逆向概率：如果我们事先并不知道袋子里面黑白球的比例，而是闭着眼睛摸出一个（或好几个）球，观察这些取出来的球的颜色之后，那么我们可以就此对袋子里面的黑白球的比例做出什么样的推测。(3)贝叶斯公式：P(A|B)=P(A)*P(B|A)/P(B)2.贝叶斯实例问题一：拼写纠正实例（我们看到用户输入了一个不在字典中的单词，我们需要去猜测“这个家伙到底想输入的单词是什么？”）
2020-05-18 20:02:13
440
原创 对信息量、熵、相对熵、交叉熵的简单理解
1.信息量：显而易见的事情。信息量较小，不常发生的事情，信息量较大。假设X是离散随机变量，其取值范围为I，概率分布P(x) = Pr(X = x)，xI，则定义事件X = x0的信息量为I(X0) = -log(P(x0))2.熵：对于某个事件，有n种可能，每一种可能性都有一个概率P(x)，熵用来表示所有信息量的期望，即H(x) = -3.相对熵(KL散度)：对于同一个随机变量X，有两个单独的概率P(X)和Q(X)，我们可以用KL散度来衡量两个分布的差异。在机器学习中，P往往用来表示样本的真
2020-05-15 14:41:05
259
原创 JS中Generator实现（yield关键字、return关键字）
1.Generator是ES6中新增的语法，和Promise一样，都可以用来异步编程。2.Generator函数和普通函数的区别：(1)普通函数：一旦执行，就会从头走到尾，不会终止。function normalFn（）{ console.log('start') console.log('middle') console.log('end')}normalFn()(2)Generator函数[1]Generator不是一个函数，定义generator时，使
2020-05-14 16:38:23
1154
1
原创 JS中Promise的实现（结合实例）以及执行顺序
1.Promise是异步编程的一种解决方案，比传统的解决方案——回调函数和时间更加合理且强大。2.特点：(1)对象的状态不受外界影响（3种状态）[1]Pending状态（进行中）[2]Fulfilled状态（已成功）[3]Rejected状态（已失败）(2)一旦状态改变就不会再变（两种状态的改变：成功、失败）[1]Pending——>Fulfilled[2]Pend——>Rejected(3)可以把Promise看成一个状态机，初始是Pending状态，可以通
2020-05-14 15:51:02
1204
原创 对JS中的继承的理解(通过构造函数绑定法，prototype模式法绑定，Object.create（）以及ES6中的extends
1.在ES5中，可以使用以下方式解决继承问题。(1)第一种叫构造函数绑定：这种构造方法，只能继承父构造器中的属性，不能继承父构造器原型上的属性。function Animal (){ this.species = 'animal';}function Cat(name,color){ Animal.apply(this,arguments); this.name = name; this.color = color;}var cat = new Cat("damao","black"
2020-05-09 16:48:43
300
原创 对JS中的防抖（debounce）和节流（throttling）的一些理解（结合实例）
1.防抖（debounce）:遇到延时函数的定时器，就重新计时(1)策略：当事件被触发时，设定一个周期延时执行动作，若周期又被触发，则重新设定周期，直到周期结束，执行动作。在后期有拓展了前缘防抖函数，即执行动作在前，设定延迟周期在后，周期内有事件被触发，不执行动作，且周期重新设定。(2)特点：[1]当事件快速连续不断触发时，动作只会执行一次。[2]延迟debounce，是在周期结束时执...
2020-05-05 18:41:51
895
原创 对JS中模块化的一些理解（CommonJS、AMD、ES6的模块化）
JS本身是不支持模块化的，只不过后来社区的一些大佬制定了一个模块化规范，主要分为两种：第一种：用于服务器端的CommonJS，比如node.js中的require。第二种：客户端的AMD，比如require.js。后来ES6提供了模块化的方案，分为导出（export）、导入（import）两个模块。1.首先介绍一下CommonJS（同步、服务端）(1)Node应用由模块组成，采用Comm...
2020-05-02 15:58:41
291
原创 对JS中深拷贝、浅拷贝的一些理解以及深拷贝常用的一些方法
1.首先我们先区分一下什么是深拷贝、什么是浅拷贝？假设B复制了A，当修改A时，看B是否发生了变化，若B也跟着变了，那么就说明这是浅拷贝；若B没变，则说明是深拷贝。2.通过阐述堆栈、基本数据与引用数据来理解深拷贝和浅拷贝。(1)基本数据类型和引用数据类型的数据存储是不一样的(2)基本数据类型——名、值都存储在栈内存中。let a = 1;当b复制a时，即b = a;栈内存会开辟一个内存...
2020-05-01 16:01:44
199
原创 对JS中的闭包（块级作用域）的一些理解（为什么有时候for循环遍历会出现错误）
1.什么是闭包？函数对其周围状态（语法环境）的引用捆绑在一起构成了闭包。也就是说，闭包可以让你从内部函数访问外部函数。在JS中，每个函数被创建时，都会在函数生成时形成闭包。2.语法作用域：function init(){ var name = '每天脱发也不能秃头'; /name是一个被init创建的局部变量 function displayName(){ //displayName...
2020-05-01 13:00:48
464
原创 对JS中执行上下文的一些理解（结合实例更好理解）
1.什么是执行上下文？当前JavaScript代码被解析和执行时所在环境的抽象概念。JS中运行的任何代码都是在执行上下文中运行的。2.执行上下文的类型有3种，分别为：(1)全局执行上下文：这是最基础的默认的执行上下文。不在任何函数中的代码都位于全局执行上下文中。它做了两件事情：[1].创建了一个全局对象，在浏览器中的全局对象为window对象。[2].将this指针指向这个全局对象。注...
2020-04-30 12:05:39
420
原创 JS中的this(通过几个例子可以加深理解)
1.首先说一下this指向的规则：this的指向在函数的定义时是确定不了的，只有函数执行时才能确定this到底指向谁，实际上 this最终的指向是那个调用它执行它的那个对象。2.下面通过几个例子加深理解一下例子1：function a（）{ var user = “每天脱发也不能秃”; console.log(this.user); //undefined console.log(...
2020-04-28 09:57:32
244
原创 对JS中操作符的一些理解：[]= =![] =>true,{}= =!{}=>false
首先通过一个典型的例题来加深对上面方法的理解：[]= =![] =>true,{}= =!{}=>false.1.根据运算符优先级，！的优先级大于= =，所以先计算！[]，！将变量转换为布尔类型。注意：null,undefined,NaN,空字符串(’’)取反为true，其余都为false。以此！[] = false。2.根据上面的规则，如果有一个操作数为布尔，在比较相等性之前转...
2020-04-27 11:49:22
489
原创 对JS中new操作符的一些理解（如何自己实现一个new函数）
new操作符用于创建一个给定的构造函数的对象实例，举个例子： function Person(name,age){ this.name = name; this.age = age; } const person1 = new Person('Tom',20); console.log(person1); //Person{name:"Tom",age:20}new关...
2020-04-27 11:01:20
544
原创 JS前端模块化
在网页开发早期，JavaScript制作作为一种脚本语言，做一些简单的表单验证或动画实现，那个时候的代码还是很少的，之江将代码写在script标签里面即可。随之Ajax异步请求的出现，慢慢就形成了前后端分离，客户端需要做的事情越来越多，代码量也是与日俱增，为了应对代码量的剧增，我们通常会将代码写在多个js文件中，进行维护，但是这种维护方式，依然不能避免一灾难性的问题，比如全局变量同名问题。而且利用...
2019-11-12 14:43:43
160
原创 Vue组件-插槽
在生活中，很多地方都有插槽，电脑的USB、电源插槽等，插槽的目的是为了让我们原来的设备具备 更多的扩展性。组件的插槽是为了让我们封装的组件更加具有扩展性，让使用者可以决定组件内部的一些东西到底展示什么。比如，移动网站中的导航栏。在移动开发中，几乎每个页面都有导航栏，这种导航栏我们必然会封装成一个插槽，比如nav-bar组件，一旦有了这个组件，我们就可以在多个页面中复用了。那么如何封装这类组件呢：...
2019-11-11 20:31:56
235
原创 父子组件之间的通信（二）
上一篇主要使用props属性和emit事件进行父子组件之间的通信，但是这种方法有局限性，父子组件之间通信的内容只能是data，不能整个对象进行传递通信，那么我们子组件怎么调用父组件中的方法呢？子组件如何调用父组件对象，有两种方式：1.使用$children，但是该方法有一定的局限性，一般不推荐使用。下面通过代码演示如何调用父组件对象。<!DOCTYPE html><htm...
2019-11-10 18:27:02
156
原创 Vue中父子组件通信的小案例
Vue中父子组件通信的小案例由于父子组件中的data是独立的，所以不能相互直接通信，但是在一些开发中，一些数据往往是需要从上级传递到下层的，比如在一个页面中，我们从服务器请求到了很多数据，其中一部分并非是我们整个页面的大组件展示的，而是需要我们小组件展示，这时，并不会让子组件再次发送一个请求，而是让大组件直接传递给小组件。那么如何进行父子组件之间的通信呢？1.父组件向子组件传递消息：通过p...
2019-11-09 23:43:45
310
原创 对Ajax的一些简单理解
初步认识AjaxAjax的简单介绍Ajax是什么首先比较一下传统的web模型与Ajax模型，两者的区别：XMLHttpRequest对象（XMLHttpRequest对象是Ajax的基础）：下面通过代码演示一下，如何通过Ajax实现客户端与服务端的传输生成一个适合你的列表创建一个表格设定内容居中、居左、居右SmartyPants创建一个自定义列表如何创建一个注脚注释也是必不可少的KaTeX数学公式...
2019-06-13 20:23:41
353
原创 ArcGIS API 入门（一）
ArcGIS API 入门（一）在3D环境中渲染一个地图下面通过一个sample简单介绍一下如何导入地图&lt;!DOCTYPE html&gt;&lt;html&gt;&lt;head&gt; &lt;meta charset="utf-8"&gt; &lt;meta name="viewpo
2019-01-21 22:42:35
1132
1
转载 Vue中mint-ui使用详解
这次给大家带来vue中mint-ui使用详解，vue中mint-ui使用的注意事项有哪些，下面就是实战案例，一起来看一下。 mint-ui在vue中的使用，供大家参考，具体内容如下首先放上mint-ui中文文档近来在使用mint-ui，发现部分插件在讲解上并不是很详细，部分实例找不到使用的代...
2019-01-13 21:55:23
610
1
转载 Vue组件
vue组件全局注册：<body> <div id='app'> <my-component></my-component> </div> <script src="http://cdn.bootcss....
2019-01-12 18:30:40
145
1
转载 webpack结合vue.js的使用
注意：有时候使用npm i node-sass -D装不上，这时候，就必须使用 cnpm i node-sass -D在普通页面中使用render函数渲染组件<!DOCTYPE html><html lang="en"><head> <meta charset="UTF-8"> <
2019-01-12 18:20:40
328
转载 webpack入门
Vue是如今前端比较火的javascript MVVM的框架，其主要思想是数据驱动与组件化。在MVVM框架中，View层和Model层相互之间是没有联系的，通过ViewModel使View和Model之间产生交互。ViewModel是Vue实例的核心，创建Vue实例主要就是创建ViewModel的各个组成部分。DOM Listener和Data Bindings可以看成数据绑定的两...
2019-01-11 19:31:18
191
空空如也
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人