自定义博客皮肤VIP专享

*博客头图:

格式为PNG、JPG,宽度*高度大于1920*100像素,不超过2MB,主视觉建议放在右侧,请参照线上博客头图

请上传大于1920*100像素的图片!

博客底图:

图片格式为PNG、JPG,不超过1MB,可上下左右平铺至整个背景

栏目图:

图片格式为PNG、JPG,图片宽度*高度为300*38像素,不超过0.5MB

主标题颜色:

RGB颜色,例如:#AFAFAF

Hover:

RGB颜色,例如:#AFAFAF

副标题颜色:

RGB颜色,例如:#AFAFAF

自定义博客皮肤

-+
  • 博客(61)
  • 问答 (1)
  • 收藏
  • 关注

原创 GRCh38版本染色体位置转换GRCh37(hg19)

hg38染色体位置转换hg19

2025-05-30 14:06:25 280

原创 python安装biopython模块时报错:WARNING: pip is configured with locations that require TLS/SSL

Python 3.11 安装时没有正确编译 SSL 支持模块 _ssl。3)手动编译 _ssl 模块。

2025-05-29 17:01:16 230

原创 biopython模块(python库)安装

biopython python库安装

2025-05-29 11:39:09 324

原创 根据基因名称自动获取染色体上的位置

根据基因名称自动获取染色体上的位置

2025-05-28 10:03:37 539

原创 常用shell命令合集

【代码】常用shell命令合集。

2025-05-14 16:22:39 229

原创 fastp数据质控

fsatp:NGS数据质控

2025-05-12 17:06:59 817

原创 Docker基础——快速掌握

通常镜像仓库分为公共镜像仓库和私有镜像仓库。私有镜像仓库则是指部署在公司或组织内部,主要用于自身应用Docker镜像存储、分发的镜像仓库。登录好后,就可以推送镜像到自己创建的仓库了,在本地推送到自定义仓库前,我们需要使用docker tag命令将镜像“重命名”。镜像是通过 Dockerfile 构建的,Dockerfile 是一个文本文件,包含了一系列指令,用于定义如何构建镜像。公共镜像仓库一般是 Docker 官方或者其他第三方组织(腾讯云,阿里云等)提供的,允许所有人注册和使用的镜像仓库。

2025-05-11 08:35:25 298

原创 从Dockerfile 构建docker镜像——保姆级教程

使用官方的 Python 3.8 镜像作为基础镜像# 设置工作目录# 将当前目录下的所有文件复制到容器的 /app 目录# 安装依赖# 暴露端口EXPOSE 80# 定义环境变量# 运行应用程序。

2025-05-09 11:09:47 390

原创 Docker容器基础操作——小白也能快速上手

Docker 容器是一种轻量级、可移植的软件打包技术,它将应用程序及其所有依赖项(如库、配置文件、环境变量等)打包在一起,形成一个独立的运行环境。CONTAINER ID :容器ID。IMAGE:容器调用的镜像名称。COMMAND:容器运行的命令。CREATED:容器创建时间。NAMES:容器名称。

2025-05-09 10:51:35 424

原创 lumpy:基因组结构变异SV的检测

lumpy变异检测软件使用

2025-05-08 15:27:48 322

原创 CherryStudio数据库同步

1、在电脑中,将所有的数据进行备份,如下图。拷贝备份结果文件夹到要导入的电脑上。选择第1步中备份的知识库文件导入。

2025-04-25 09:24:45 234

原创 大模型:无问芯穹(当前免费哦)

1、注册。

2025-04-23 14:52:15 182

原创 Cherry Studio构建deepseek本地知识库(保姆级教程)

官网首页提供Windows/macOS/Linux三端安装包下载入口,建议先行下载客户端但暂不安装。2)选择手机号注册并完成短信验证,填写推荐码获取初始2000万Token奖励(注册链接已带邀请码),设置8-16位包含特殊字符的高强度密码;3)实名认证:(为保障API调用权限,需在硅基流动控制台完成实名核验)3)记录API接入地址(默认为api.siliconflow.cn)下载完以后先不着急安装,还需要注册计算平台的账户。1)点击新建密钥并自定义命名(建议包含设备标识),若已经有账号,可以跳过此步骤;

2025-04-23 14:14:34 304

原创 ModuleNotFoundError: No module named ‘NoteBook‘

ModuleNotFoundError: No module named 'NoteBook'

2025-04-16 10:31:43 192

原创 shell:按照染色体拆分fasta

【代码】shell:按照染色体拆分fasta。

2025-03-25 14:15:06 83

原创 华为云deepseek大模型平台:deepseek满血版

华为云deepseek大模型平台注册:https://cloud.siliconflow.cn/i/aDmz6aVN。填写邀请码的话邀请和被邀请的账号都会获得2000 万 Tokens。邀请码:aDmz6aVN。

2025-02-19 10:55:57 944

原创 SRA Toolkit下载工具安装

sratoolkit的安装与使用

2025-02-13 13:50:11 451

原创 普通用户授权docker使用权限

centos系统普通用户的docker授权

2025-02-11 17:02:31 765

原创 bedtools:提取指定范围的vcf

【代码】bedtools:提取指定范围的vcf。

2025-02-06 09:10:22 153

原创 centos报错:无法访问/mnt: 传输端点尚未连接

ls: 无法访问/mnt: 传输端点尚未连接WARN: volume was not unmounted cleanly.

2025-01-15 17:26:57 238

原创 Centos7将/dev/mapper/centos-home磁盘空间转移到/dev/mapper/centos-root

Centos7将/dev/mapper/centos-home磁盘空间转移到/dev/mapper/centos-root

2025-01-15 17:23:05 680

原创 报错:RuntimeError: Compression requires the (missing) zlib module

报错:RuntimeError: Compression requires the (missing) zlib module。执行 python3 setup.py install。

2025-01-15 16:22:34 241

原创 yum报错:No module named yum

yum重新安装

2025-01-10 14:27:00 684

原创 yum系统报错:SyntaxError: multiple exception types must be parenthesized

File "/usr/bin/yum", line 30 except KeyboardInterrupt, e: ^^^^^^^^^^^^^^^^^^^^SyntaxError: multiple exception types must be parenthesized

2025-01-10 09:51:58 890

原创 yum换源

centos换yum源

2025-01-09 17:18:54 193

原创 centos7连接wifi

其他:参考https://www.bilibili.com/opus/758775517181640742。插上usb无线网卡(自带驱动版)

2025-01-09 14:55:19 284

原创 centos server系统新装后的网络配置

centos 网络配置

2024-12-25 15:00:34 461

原创 ngs-bits:性别检测

链接:https://pan.baidu.com/s/1StQVlXeLfyoNYjbw9TrjUw。由于前不久docker hub封禁问题导致下载受限,十分不便,所以自己做了镜像包。镜像下载链接:ngs-bits2024_08-88.tar.gz。ngs-bits的性别判断模块:SampleGender。功能:ngs-bits 2024-08-88 ()系统:2024.04版本的ubuntu系统。

2024-11-15 10:11:46 217

原创 将硬盘下的指定路径挂载到指定路径下:mount --bind

1、将硬盘下的路径挂载到指定路径。

2024-04-03 11:38:46 602

原创 centos7.9MINI系统安装后无法挂载磁盘

centos7 MINI,挂载,mount

2024-01-22 15:26:30 1294 1

原创 bcftools ./configure失败报错

bcftools安装报错:1)configure: error: libbzip2 development files not found;2)configure: error: liblzma development files not found

2023-04-01 22:36:44 1196

原创 fatal: The upstream branch of your current branch does not match the name of your current branch.

git error; fatal: The upstream branch of your current branch does not matchthe name of your current branch.

2022-06-21 12:24:53 586

原创 qiime2安装

conda的方式安装安装:https://docs.qiime2.org/2022.2/install/native/#miniconda使用:https://forum.qiime2.org/t/qiime2-chinese-manual/8381、安装sudo /opt/miniconda3/bin/conda update condasudo wget https://data.qiime2.org/distro/core/qiime2-2022.2-py38-linux-conda.yml

2022-03-11 14:57:17 1520

原创 git ignore:忽略不想上传的文件或目录

1、将不想上传的文件写在.gitignore中配置规则如下:# # 此为注释 – 将被 Git 忽略*.bak # 忽略所有 .bak 结尾的文件/DB # 仅仅忽略项目根目录下的 DB 文件,不包括 /其他路径/DBdatabase/ # 忽略 database/ 目录下的所有文件file/*.txt # 会忽略 file目录下所有带.txt后缀的文件, 但不包括 file/file2/*.txt!main. # 但 main.txt 除外(排

2022-03-03 14:22:56 1267 1

原创 创建 SSH key

创建 SSH key1、检查是否已存在ssh keyls -al ~/.ssh2、生成新的ssh keyssh-keygen -t rsa -C "myemail@example.com"3、输入passphrase(可跳过)设置passphrase后,进行版本控制时,每次与GitHub通信都会要求输入passphrase,以避免某些“失误”4、将新生成的key添加到ssh-agent中# start the ssh-agent in the backgroundeval "$(ssh

2022-03-03 12:19:12 2449

原创 bedtools2安装报错:fatal error: zlib.h

安装bedtools,执行make报错如下:Building BEDTools:=========================================================DETECTED_VERSION = v2.25.0CURRENT_VERSION = Updating version file. * Creating BamTools API- Building in src/utils/bedFile * compiling bedFile.cppIn

2021-07-28 13:28:34 590

原创 奇怪的问题:control + v(粘贴)时多了00~ ~01

简介不定期多次出现的奇怪问题:复制字符串,粘贴时,粘贴的结果收尾会多一串字符:00~ ~01解决办法printf "\e[?2004l"参考文章bracketed paste mode

2021-07-15 12:00:48 1785

原创 笔记:CMDB-大规模中国人群体变异频率数据库

CMDB:大规模中国人群体变异频率数据库简介安装1、命令行直接安装2、git安装3、查看帮助信息使用1、API使用许可1.2 使用1.2.1 登录1.2.2 查询1.2.2.1 位点信息查询1.2.2.2 注释到vcf1.2.3 登出简介CMDB(全称是Chinese Millionome Database),大约包含了9M个高质量的变异位点(约占人类基因组总长的0.003)。数据库网站的第一版是参考ExAC做的,使用的底层框架是常见的Nginx+Flask+MongoDB。可通过Genome API

2021-05-13 11:05:03 1409

原创 Error: mount: 未知的文件系统类型“ntfs”

mount: 未知的文件系统类型“ntfs”问题描述原因解决方法使用参考问题描述执行“mount”挂载外置硬盘时报错,如下:mount: 未知的文件系统类型“ntfs”原因系统不支持ntfs文件。解决方法需要安装软件包(地址:https://www.tuxera.com/company/open-source/)安装命令如下:#下载wget https://tuxera.com/opensource/ntfs-3g_ntfsprogs-2017.3.23.tgz#安装(需要root

2021-05-12 10:21:06 4096 1

原创 系统同时支持pip2与pip3

系统同时支持pip2与pip3Today……检查环境安装步骤使用Today……今天一个小姐姐需要在公共服务器上安装pandas,但是服务器的pip默认python3库。安装完后只有python3能用python2仍然检索不到这个包,所以求助了帅气的我(嫩脸一红)……检查环境为了不影响已有的环境配置,期望pip2和3可分开调用,所以先检查环境。1、查询pip默认版本和路径which pippip -V显示默认:pip32、查看已有的python版本ll /usr/bin/python*

2021-05-05 14:26:05 324

空空如也

TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹

TA关注的人

提示
确定要删除当前文章?
取消 删除