R数据分析:孟德尔随机化实操

本文通过实例演示如何利用R语言进行孟德尔随机化分析,详细介绍了从选择基因工具变量到完成敏感性分析的全过程。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

好多同学询问孟德尔随机化的问题,我再来尝试着梳理一遍,希望对大家有所帮助,首先看下图1分钟,盯着看将下图印在脑海中:

上图是工具变量(不知道工具变量请翻之前的文章)的模式图,明确一个点:我们做孟德尔的时候感兴趣的是x和y的关系,也就是小b,但是我们直接去跑x对y的回归肯定是不对的,因为有很多的U,因此我们借助工具变量G(关于工具变量我们之前的文章有详细的解释,请自行查阅),去估计我们感兴趣的小b。

现在有天然良好的工具变量G,也就是我们的基因变量,此时有上面的图,再次重申:我们感兴趣的,最终希望得到准确估计的值是小b,按照上图我们应该有GY的关系是ab,GX的关系是a,于是乎b可以写成ab/a,就是我们感兴趣的b可以换一种思路得到,如下:

上面的式子要跑通的话,我们需要知道G-Y的关系和G-X的关系。

但是我们GY也就是基因和结局的关系已经有人给我们研究好了,我们可以直接去GWAS里面找研究好的summarydata拿来用就行。

但是我们的的GX也就是基因和暴露的关系也已经有人给我们研究好了,我们可以直接去GWAS里面找研究好的summarydata拿来用就行。

也就是说,通过孟德尔随机化,我们完全可以毫不费力地估计出我们需要的小b,也就是暴露和结局的关系----就是今天要再次给大家介绍的孟德尔随机化研究。

思路就是这么清晰。就是这么清晰。搞不明白的同学再多读几遍。

<
评论 6
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

公众号Codewar原创作者

你的鼓励将是我创作的最大动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付:¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足,请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值