Mac升级为Sierra后安装caffe的问题

三年前的Mac到手后一直懒得做更新，主要是因为系统升级后一些有依赖的软件都需要更新，有时还挺容易出问题。为了安全稳定起见，OSX 10.9系统就被我用了三年。但是，这么久不更新实在跟不上潮流了，最近想安装TensorFlow，结果我这么旧的系统被它鄙视并且拒绝了，只好趁着假期把系统更新一下。结果一更新，原来的caffe就用不了，编译过程出现了些问题，本博文记录了这些问题和对应的解决方案。

更新后，系统及相关软件的版本为：
OSX 10.12.4 (Sierra)
Xcode 8.3.2
Cuda 8.0.61
cuDNN 5.0
Matlab2016b

caffe具体的安装过程见《深度学习框架Caffe在Mac上的安装和测试》，这里使用的是基于Anaconda的安装。Xcode和Cuda都是最新的，但是编译caffe的过程中发现cuda 8.0不支持Xcode 8.3，报错为：

nvcc fatal : The version ('80300') of the host compiler ('Apple clang') is not supported

通过搜索发现，cuda 8.0是支持Xcode 8.2的，于是将Xcode降为8.2版本。解决步骤为：
1， 登录apple开发者网站：https://developer.apple.com/downloads/
2， 下载命令行工具： Command Line Tools (macOS 10.12) for Xcode 8.2
3， 安装Command Line Tools
4， 将Xcode改为命令行工具对于的8.2版本，运行

sudo xcode-select --switch /Library/Developer/CommandLineTools

5， 查看clang的版本, 为8.0.0

$ clang --version
Apple LLVM version 8.0.0 (clang-800.0.42.1)
Target: x86_64-apple-darwin16.5.0
Thread model: posix
InstalledDir: /Library/Developer/CommandLineTools/usr/bin

于是使用make重新编译caffe即可。
运行 make， make test都没有问题，但是到了make runtest这一步，又出现以下问题：

$ make runtest
.build_release/tools/caffe
dyld: Library not loaded: @rpath/./libhdf5_hl.10.dylib
  Referenced from:.build_release/tools/caffe
  Reason: image not found

这个问题的原因是caffe没有成功连接到Anaconda安装的libhdf5_hl.10.dylib。解决办法如下：
1， 用otool查看caffe的连接库。

$ cd build/tools
$ otool -L caffe | grep rpath
    @rpath/libcaffe.so.1.0.0-rc3 (compatibility version 0.0.0, current version 0.0.0)
    @rpath/libcudart.8.0.dylib (compatibility version 0.0.0, current version 8.0.61)
    @rpath/libcublas.8.0.dylib (compatibility version 0.0.0, current version 8.0.61)
    @rpath/libcurand.8.0.dylib (compatibility version 0.0.0, current version 8.0.61)
    @rpath/libhdf5_hl.10.dylib (compatibility version 12.0.0, current version 12.0.0)
    @rpath/libhdf5.10.dylib (compatibility version 13.0.0, current version 13.0.0)
    @rpath/libcudnn.5.dylib (compatibility version 0.0.0, current version 5.0.5)
    @rpath/libpython2.7.dylib (compatibility version 2.7.0, current version 2.7.0)

可以看到caffe连接到了@rpath/libhdf5_hl.10.dylib 而不是Anaconda中的hdf5。
2， 使用install_name_tool -change 重新设置hdf5的连接

$ install_name_tool -change "@rpath/libhdf5_hl.10.dylib" "/Users/taigw/anaconda/lib/libhdf5_hl.10.dylib" caffe
install_name_tool -change "@rpath/libhdf5.10.dylib" "/Users/taigw/anaconda/lib/libhdf5.10.dylib" caffe

3, 对libcaffe.so和test_all.testbin做同样的修改

$ cd ../lib
$ otool -L libcaffe.so | grep rpath
$ install_name_tool -change "@rpath/libhdf5.10.dylib" "/Users/taigw/anaconda/lib/libhdf5.10.dylib" libcaffe.so
$ install_name_tool -change "@rpath/libhdf5_hl.10.dylib" "/Users/taigw/anaconda/lib/libhdf5_hl.10.dylib" libcaffe.so
$ cd ../test
$ otool -L test_all.testbin | grep rpath
$ install_name_tool -change "@rpath/libhdf5_hl.10.dylib" "/Users/taigw/anaconda/lib/libhdf5_hl.10.dylib" test_all.testbin
$ install_name_tool -change "@rpath/libhdf5.10.dylib" "/Users/taigw/anaconda/lib/libhdf5.10.dylib" test_all.testbin

再次运行make runtest就能通过了。

之后依次运行make pycaffe和make matcaffe，在make matcaffe完成后在matlab中调用caffe时出现了和上面类似的错误，说caffe_mexmaci64找不到@rpath/./libhdf5_hl.10.dylib，解决办法如下：

在caffe安装的更目录下，运行：

$ cd matlab/+caffe/private/
$ install_name_tool -change "@rpath/libhdf5_hl.10.dylib" "/Users/taigw/anaconda/lib/libhdf5_hl.10.dylib" caffe_.mexmaci64
$ install_name_tool -change "@rpath/libhdf5.10.dylib" "/Users/taigw/anaconda/lib/libhdf5.10.dylib" caffe_.mexmaci64

问题得到顺利解决。于是可以在新系统上一边玩caffe一边玩TensorFlow了。