2022.03.03 R语言相关系数制图

1、下载R语言包及RStudio

2、打开RStudio，新建R Script

3、修改工作目录 

4、把需要相关性分析的数据复制到txt文本中

5、输入如下代码：首次需要安装“corrplot”包，在框中输入install.packages("")，下同。

library('corrplot')
library('RColorBrewer')
dat <- read.table('2.txt', header = T, sep ='\t')
dat <- as.matrix(dat)

corr <- cor(dat)

corrplot(corr)
corrplot.mixed(corr, lower.col = "black", number.cex = .7, 
               upper = 'square', order = "hclust",
               upper.col = brewer.pal(n = 8, name = "PuOr"))

6、或如下代码（首次需要安装“PerformanceAnalytics”包）

library(Hmisc)#加载包
dat <- read.table('3.txt', header = T, sep ='\t')
dat <- as.matrix(dat)
res2 <- rcorr(as.matrix(dat))
res2

library(PerformanceAnalytics)#加载包
chart.Correlation(dat, histogram=TRUE, pch=19)

遇到问题：

尚不知如何调整参数、图例字体大小。

为节省时间，第5步生成的图暂且通过PS橡皮擦和文字插入解决；第6步生成的图暂且通过adobe acrobat pro修改文字（由于数据量大，编辑的时候非常卡）。

相关链接： 

R语言官网：Download R-4.1.2 for Windows. The R-project for statistical computing.

RStudio官网：RStudio | Open source & professional software for data science teams - RStudio

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