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原创 sgRNA的靶基因基因组如何获得？ for 下游的 T7E1验证

T7E1酶切验证时，靶标区域引物设计。

2025-05-20 16:27:21 324

原创 提高小鼠繁殖率的方法

小鼠的繁育

2025-03-25 16:40:35 452

原创 CreERT2小鼠，都有哪些花样？

CreERT2

2025-03-22 11:13:01 284

原创 Genotyping的PCR程序总结

Genotyping

2025-02-18 08:58:15 210

原创 PCR-Mix总结

PCR-Mix

2025-02-10 09:02:47 572

原创 CreERT2 的诱导敲除是个啥

诱导敲除系统

2025-01-26 16:36:47 377

原创 Tamoxifen(他莫昔芬)的配置

经验分享

2025-01-18 20:00:34 755

原创 引物设计的一些规则和小Tips

验证cas9蛋白的有无

2025-01-12 12:22:21 869

原创 单链DNA寡核苷酸链的同源重组建库（CRISPR sgRNA 建库）

sgRNA pool

2025-01-06 08:50:59 390

原创 检测sgRNA的编辑效率

sgRNA 的编辑效率

2024-12-29 15:23:24 416

原创 关于画火山图（by ggplot2）的一些总结和经验

火山图 by ggplot2

2024-12-21 14:46:23 880

原创 SCENIC-Regulon的热图怎么实现？

调节子

2024-12-15 16:46:33 440

原创 GSEA展示4个样本组在转录组水平的相似性

GSEA 评价4个样本（2对）在转录组水平相似度

2024-12-07 18:19:10 563

原创 如何用Cytoscape::EnrichmentMap 可视化GSEA的运算结果？

Cytoscape::EnrichmentMap 可视化GSEA

2024-11-29 21:36:45 619

原创 如何用cytoscape画细胞通讯的结果？

细胞通讯结果的可视化

2024-11-21 15:31:10 341

原创 Copykat中如何出CNV的热图？

染色体的编号 → 拷贝数变异的情况

2024-11-14 19:18:54 949

原创 EnrichmentMap 该怎么用？方法和流程的建立过程

Enrichmentmap函数和使用方法

2024-10-31 23:26:51 668

原创 差异基因富集的通路有很多；如何进行功能的聚类分群？

功能（pathways）的聚类

2024-10-25 21:24:21 838

原创 如何识别并分类转录因子的家族

拿到对转录因子的家族分类

2024-10-17 21:28:07 535

原创 如何鉴定一段抗体序列的CDR区（CDR1、CDR2、CDR3）

抗体分区

2024-10-11 14:19:54 2017

原创 单细胞中的GSVA基因集评分怎么实现？

GSVA 基因集评分

2024-09-30 20:56:45 1171 1

原创 iRegulon的使用：去识别给定基因集合中关键的调控因子

iRegulon 的使用

2024-09-26 10:00:22 346 1

原创 解决NumbaWarning error的报错

NumbaWarning

2024-09-18 12:45:01 707

原创 基于scRNA-data,运用pySCENIC寻找细胞群里面活跃的调节子

细胞群中top pioneering forces TF

2024-09-14 21:36:28 454

原创 scRNA-data中的R值

相关性

2024-09-06 17:07:32 592

原创 jjVolcano 展示多组的差异基因，scRNA很受用

jjVolcano 火山图

2024-08-21 10:32:59 861

原创 使用ggplot2 DIY Dotplot：即能在XY轴映射2种分类

DIY Dotplot

2024-08-15 20:11:35 922

原创 多层嵌套柱状图适配了: n个scRNA-data的可视化需求

多层嵌套柱状图

2024-08-14 18:07:00 892

原创 单细胞数据怎么表现genes mRNA表达的热图？

简单热图

2024-08-04 17:43:38 382

原创 计算R velocity的方法和流程（CellRank2）

cellranger-count & velocyto & cellrank2

2024-07-28 22:44:50 976

原创 monocle3拟时序分析怎么做到多样本间pseudotime值可比？

monocle3

2024-07-19 19:51:25 538

原创 细胞通讯之cellchat的流程

cell-cell communication

2024-07-10 18:49:29 1415

原创 scRNA-data数据如何画3D PCA图？

PCA 主成分分析

2024-07-05 13:55:57 1059

原创 7.ArchR的onto整合（3）

Healthy-Like样细胞的鉴定 & Disease-Like样细胞的celltype的注释

2024-06-13 13:24:06 909

原创 7.ArchR的onto整合（2）

Healthy-like 样细胞的鉴定

2024-05-09 19:49:26 867 1

原创 7.ArchR的整合（1）

欢迎批评指正

2024-04-28 21:40:54 1228 4

原创 6.ArchR的可视化（6）：发育轨迹

欢迎留言

2024-04-25 18:22:18 809 2

原创 6.ArchR的可视化（5）：共可及性co-accessibility

欢迎ArchR的爱好者们的留言交流讨论

2024-04-25 12:27:19 875 1

原创 6.ArchR的可视化（4）：TF的Footprint

TF的Footprint

2024-04-24 16:36:02 1843

原创 6.ArchR的可视化（3）：TF的序列标识图

2）greenleaf文中的对这一部分的描述如下：We used the cell-by-peaks and the Catalog of Inferred Sequence Binding Preferences (CIS-BP) motif (from chromVAR motifs ‘human_pwms_v1’) matches within these peaks from motifmatchr ”matchMotifs(positions=out)“可视化一段序列某个位点的保守性；

2024-04-24 10:05:53 707

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