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原创 带你读论文:WL算法到神经网络:high-order GNN

论文:《Weisfeiler and Leman Go Neural: Higher-Order Graph Neural Networks》发表于AAAI-2019文章脉络:1.证实了GNN在非同构图区分上并不比WL算法强,并且在某种特定情况下,GNN与WL算法具有同等效力,所以也具有相同的问题2.从K-WL算法受到启发提出了K-GNN模型,从粗细粒度方面能够更好的提取信息3.实验证实了文章提出的higher-order GNN对于图分类和图回归都十分重要文章在介绍相关方法时主要分成了两部分

2020-12-07 13:42:29 2736 2

原创 带你读论文:分子图表示学习

论文:《Hierarchical Inter-Message Passing for Learning on Molecular Graphs》背景介绍:分子图表示学习:一般来说,我们所使用的一些方法是对一个图中的结点或者边进行表示学习,学习出他的embedding,而分子图表示学习是指学习出一整个分子图的embedding。分子图表示学习的意义:1.对于分子特征或者功能学习有重要意义2.对于我们当前的一些任务,使用SMILES等方式来表示分子结构或者序列,丢失信息较多,有时SMILES等特征发

2020-12-07 13:37:40 1901

原创 带你读论文:用于药物重用的二分图卷积网络

论文:《Toward heterogeneous information fusion: bipartite graph convolutional networks for in silico drug repurposing》一部分内容取自于我的ppt背景:1.药物重用是指开发已有药物的新的治疗目标,即“老药新用”。这是现在一些做drug-disease工作的替代名字。2.数据越来越丰富,但是由于疾病的分子异质性和多种药物-疾病的关联,以及PPI网络尚未完全研究清楚,DR的研究具有挑战性。 DR

2020-12-07 13:34:54 846 2

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