基因组测量与生物信息学方法全解析
在基因组研究领域,多种测量和分析方法不断涌现,为深入了解基因奥秘提供了有力工具。下面将详细介绍一些常见的基因组测量方法、测序技术以及生物信息学的算法、管道和方法。
荧光原位杂交(FISH)
FISH(荧光原位杂交)是一种基于杂交的基因组测量方法。它主要有三方面应用:
- 检测染色体中的特定基因 :能够确定基因在染色体上的位置和数量。
- 判断细胞染色体情况 :确定单个细胞是否缺失或有额外的染色体。
- 染色体核型分析 :创建细胞染色体的彩色图谱。
尽管FISH测试在一定程度上被其他测试所取代,但在特定应用中仍有使用。和大多数基于杂交的方法一样,严格遵循实验方案并由经验丰富或训练有素的技术人员操作,对于获得准确结果至关重要。
测序技术
测序技术是基因组研究的核心,主要包括桑格测序和下一代测序。
- 桑格测序 :能提供中等长度(500 - 800碱基)的准确DNA测序结果,曾用于构建第一个高质量人类基因组。对于单个基因或外显子,桑格测序成本较低,但大规模测序时费用较高。下一代测序方法则提供了更多灵活性(如RNA - Seq)和更廉价的选择。不过,桑格测序仍常被视为测序的金标准,尽管这种观点正在发生变化。该技术主要通过赛默飞世尔(原应用生物系统/生命技术公司)和普洛麦格平台提供。
- 下一代测序 :2000年代中期至后期,多种测序平台广泛应用,从多方面扩展了测序的应用范围。
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