批量多分类logistic回归并导出结果

这篇博客主要介绍了如何使用R语言进行批量多分类logistic回归,通过multinom()函数实现147次回归分析,每个代谢物对应多个分组的OR值。文章强调了理解模型原理和参数设置的重要性,并分享了学习资源与心得。

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待解决问题:

做代谢组学分析,一共有147种代谢物,需要每个单独和其他选定的协变量一起放入线性回归模型中,依次替换147种代谢物,完成147次回归分析。


实现步骤:

R语言

1、 数据预处理:excel和spss
2、 for循环
3、 multinom() 线性回归
4、 导出结果分析


步骤1、2、4参见我之前写的《批量线性回归并整理导出结果到word文档》,这里只讲批量multinom() 线性回归的核心步骤。

具体操作:

3. multinom() 线性回归

timo <- data.frame() #先创建一个空数据框,否则后面<- 赋值会提示找不到timo
for (q in c(222:368)){
   
  result <- multinom(tdata$Y <
### 使用PMML进行逻辑回归分析 逻辑回归是一种广泛应用于分类问题中的统计学习方法,在金融领域尤其适用于风险评估和预测。通过将逻辑回归模型导出为PMML格式,可以在不同平台上轻松共享和部署这些模型。 为了创建使用基于PMML的逻辑回归模型,通常会经历以下几个过程: #### 创建逻辑回归模型将其实例化到PMML文件中 利用`sklearn2pmml`库可以方便地完成这一操作。下面是一个具体的例子,展示了如何训练一个逻辑回归模型,将其转换为PMML格式存储下来[^4]。 ```python from sklearn.linear_model import LogisticRegression from sklearn.datasets import load_iris import pandas as pd from sklearn2pmml.pipeline import PMMLPipeline from sklearn2pmml import sklearn2pmml # 加载数据集 data = load_iris() df = pd.DataFrame(data.data, columns=data.feature_names) X = df[['sepal length (cm)', 'sepal width (cm)', 'petal length (cm)', 'petal width (cm)']] y = data.target # 构建管道拟合模型 pipeline = PMMLPipeline([ ("classifier", LogisticRegression()) ]) pipeline.fit(X, y) # 导出至PMML文件 sklearn2pmml(pipeline, "LogisticRegressionIris.pmml", with_repr=True) ``` 这段代码首先定义了一个包含逻辑回归估计器在内的流水线对象;接着用给定的数据进行了模型训练;最后一步则是把整个流程连同所学得参数一起序列化到了指定路径下的`.pmml`文件里。 #### 载入已有的PMML逻辑回归模型执行预测 一旦有了上述生成好的PMML文件之后,就可以借助于其他工具或编程环境来进行推理计算了。这里给出一段Python脚本片段说明怎样读取这个外部资源进而实施批量打分任务[^2]。 ```python from sklearn_pmml import PMMLPipeline # 初始化PMMLPipeline实例通过传参加载本地存在的PMML文档 pipeline = PMMLPipeline.from_pmml('LogisticRegressionIris.pmml') # 对新样本做概率预估 predictions = pipeline.predict_proba(X_test) print(predictions) ``` 此部分实现了从磁盘上恢复先前保存下来的PMML表示形式,调用了其内置的方法来获取测试集中各条记录属于各个类别的可能性大小。
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