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方法一：下载到本地，load模型时使用下载到项目中的路径。方法二：使用huggingface_hub。方法三：临时脚本设置。
2025-04-18 09:26:47
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原创 【训练记录】detr训练问题
另：做的是医学图像，尝试修改cocdataset直接读入，train成功val失败，尚未处理，选择转为别的格式。期间参考了MedYOLO的dataset.py。
2025-04-11 15:06:05
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原创 【论文阅读】Segment Anything for Microscopy
（问题）尽管为此目的开发了许多工具，但显微图像中对象的仍然是许多研究人员的瓶颈。（主角）在这里，我们介绍了Segment Anything for Microscopy（），这是一种用于多维显微镜数据分割和跟踪的工具。它基于Segment Anything，一种用于图像分割的视觉基础模型。（方法）我们通过光学和电子显微镜的通才模型来扩展它，这些模型明显提高了广泛成像条件下的分割质量。（扩展）我们还在中实现了和自动分割，可以加快不同的分割任务，并为不同显微镜模式的显微镜注释提供统一的解决方案。
2025-03-07 16:03:43
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原创 mamba安装记录
基本的cuda和torch安装，注意两者版本匹配mamba_ssm有版本匹配问题，https://github.com/state-spaces/mamba/releases 在这里找指定torch版本的VMamba inference过程中有改lib库代码，记得是注释掉了一行
2025-01-07 22:17:00
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原创 【论文阅读】Data-driven regularization lowers the size barrier of cryo-EM structure determination
Nature Methods (2024)（问题背景）Macromolecular structure determination by electron cryo-microscopy (cryo-EM) is limited by the alignment of noisy images of individual particles. Because smaller particles have weaker signals, alignment errors impose size limitat
2024-07-01 22:07:18
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原创 dynamo使用教程
相似的粒子与相似的参考有更高的相关性，最终会聚集在一起。每个粒子在表中都有一个条目，包含移动和旋转来描述它的方向(默认情况下，这些值初始化为零)。当您打开一个新的断层图时，请确保在被要求时从内存中删除模型池。这对存储在磁盘中的模型没有影响，并且为了确保您没有混合来自不同层析图的模型，这是必要的。对于现实生活中的断层图，请记住，在将文件加载到内存之前，您需要预先保存这些文件。在新窗口中，将数据名称更改为有意义的名称，例如thermosomeParticles，将边长从32更改为48，然后单击。
2023-10-17 20:08:01
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原创 【论文阅读】Cyro-EM数据处理软件Dynamo
首先，Dynamo允许用户透明地适应各种高性能计算平台，如gpu或CPU集群。其次，Dynamo通过GUI界面和脚本资源实现了用户友好性。第三，Dynamo通过插件API提供用户灵活性。除了校准和平均程序，Dynamo还包括用于可视化和分析结果和数据的本地工具，以及对第三方可视化软件的支持，如Chimera UCSF或EMAN2。作为这些功能的一个演示，我们研究了细菌鞭毛马达，并显示自动检测的类缺乏和存在的c环。
2023-10-13 11:00:28
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原创 【论文阅读】DeepContact:基于电子显微镜成像的MCS高通量量化
膜接触点（MCS）介导的细胞器间的相互作用在细胞中发挥着重要作用。对MCSs的定量分析揭示了在各种生理和病理条件下细胞反应。然而，目前还缺乏一种有效的定量分析工具，在这种背景下，作者就开发了DeepContact，一种用于优化细胞器分割和接触分析，基于无标签EM的深度学习协议。DeepContact在交互式可视化方面具有高效率和灵活性，能适应细胞器的新形态，并能识别多种宽度范围内的接触，从而能对多个系统中各种类型的MCS进行统计分析。
2023-09-13 21:36:20
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原创 【算法可视化】数据结构与算法可视化网站
【VisuAlgo】数据结构和算法动态可视化https://visualgo.net/zh【Data Structure Visualizations】https://www.cs.usfca.edu/~galles/visualization/Algorithms.html【Algorithm Visualizer】（提供java、c++、js代码）https://algorithm-visualizer.org/...
2021-03-26 20:41:57
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原创 JAVA参考网页
Java参考网页整体整体【Howj2】 Java基础教程https://how2j.cn/【廖雪峰】Java教程https://www.liaoxuefeng.com/wiki/1252599548343744/1255876875896416
2021-03-07 21:50:42
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原创 【VSCode】 : launch.json常用属性
launch.json常用的具体含义如下：${workspaceRoot}the path of the folder opened in VS Code(VSCode中打开文件夹的路径)${workspaceRootFolderName}the name of the folder opened in VS Code without any solidus (/)(VSCode中打开文...
2020-03-09 20:26:47
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空空如也
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