医学图像配准工具ANTs的配置和入门

目前新版可直接运行一下命令进行安装(只适用于MacOS和Linux),详细可参考github

pip install antspyx

基于命令行的Ants工具:官方介绍文档

注意,一定要特别注意!!!!
用这个库会自动生成一个 “.mat” 文件和一个".nii.gz"文件存放在tmp目录中,并且不会自动删除(按道理临时文件会自动删除,但是我当时并没有自动删除这些临时文件)。一般tmp目录所在分区在系统创建的时候都会比较小,如果跑代码的时候配了多个病人并且没有删除中间文件,那么这个分区很快就会爆的,到时就会出现各种问题,如果还不小心重启了甚至会进不去系统(别说了,惨痛的教训)。
对于Linux分区配置可参考博客:Ubuntu报错“写入失败(设备上没有空间),因为错误消息指示这是由于磁盘已满”,[即./boot分区空间不足问题]的完美解决方案

建议在使用这库的时候,最好加上下面的代码,删除配准产生的中间文件:

for name in os.listdir(r'/tmp'):
    if name[-4:] == '.mat' or name[-7:] == '.nii.gz':
        os.remove(os.path.join(r'/tmp', name))

参考链接:
https://blog.csdn.net/zuzhiang/article/details/104930000
https://blog.csdn.net/weixin_43718675/article/details/102606717

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