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原创 真.从0开始的bulk RNA-seq分析 2.搭建一个分析平台
为什么要搭建Linux服务器?#答:因为绝大多数分析软件以及流程都在Linux上#为什么要用虚拟机?#答:没租过服务器、而且主要是练习,数据量不是很大,比如按1最终筛选得到的数据不超过15G#为什么要用ubuntu#答:学习生信技能树的视频在做,他用的ubuntu#说是从0开始,但是我建议在进行流程之前你得先点亮以下技能树:1.linux集群操作基础:常用的指令(或者你会临时搜)、文件夹路径的概念(绝对路径、相对路径)
2025-03-04 19:06:00
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原创 真.从0开始的bulk RNA-seq分析 1.从论文获取数据
任意点击一个进去就能查看这些数据的详细信息,比如下图就是M1 Kidney的RNA-seq数据(即M1号猴的肾bulk转录组),以及该数据对应的数据大小1.9G。接下来我们点击Study栏目下的PRJNA355209项目,该项目包含了所有SRP096937的数据,以及一些背景知识,如物种名与总数据量大小;了解到相关信息后,我们检索并筛选相关的数据,点击该页面右上角的related information下的SRA选项,将所有的数据选中后,点击右上角send to,选择Run Selector,进入筛选器。
2024-10-09 21:08:34
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空空如也
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