pheatmap输出pdf为空白

Question

pdf()
pheatmap()
dev.off()

使用上述代码绘制图形并输出结果时，一直报错，内容如下：

Error in dev.off() : 不能关闭一号装置(无效装置)

试了几种方法均未解决，请问会是什么原因呢？

Answer 1

让阿豪来帮你解答，本回答参考chatgpt3.5编写提供，如果还有疑问可以评论或留言

这个错误通常是因为在调用`dev.off()`函数时，没有先创建图形设备。在R中，绘图函数会自动创建图形设备，但在调用`dev.off()`关闭设备时，需要确保设备已经被创建。 解决方法：

1. 首先，确保在调用pdf()函数创建pdf图形设备之后才调用pheatmap()函数生成图形。
2. 在调用dev.off()关闭设备之前，要确保图形已经生成完成。
3. 如果是在RStudio中运行代码，尝试重新启动R会话或者重启RStudio，有时候是因为之前的绘图设备未正确关闭导致的问题。 以下是一个示例代码，演示如何正确使用pdf()，pheatmap()和dev.off()函数：

# 创建pdf图形设备
pdf("heatmap.pdf")
# 使用pheatmap函数生成热图
pheatmap(data, color = colorRampPalette(c("blue", "white", "red"))(20))
# 关闭pdf图形设备
dev.off()

通过以上方法，可以确保正确地关闭图形设备，避免出现"不能关闭一号装置(无效装置)"的错误。